京都・清水寺の本堂から張り出した「舞台」に見られるような伝統的な貫（ぬき）接合に、現代の工法を加え、剛性を高めています。各工区では、技術を結集させた接合部となっており、見え方も含めて違いを楽しめます。
伝統的な貫工法では、柱と横架材の接合部の補強に木栓が使われますが、大林組工区では、横架材を金物（鋼板とラグスクリューボルト）で補強しています。

大屋根は、万博閉幕後、構造体を解体、再利用される予定です。そのため、構造体をきれいな状態で解体する方法を検証するため、組み立て前に、組み立て・解体の実大実験（モックアップ製作）を行い、「残す解体」を実践しました。

大林組工区では、国産材の活用を推進するため、柱材の約50％程度（※1）を四国産のヒノキ、梁材には福島産のスギを採用しています。それらの材木は、福島県双葉郡浪江町にある国内最先端の大規模集成材生産工場で、集成材に製造され、柱・梁に必要な加工が行われています。
床材は、四国産のヒノキとスギを加工したCLT（直交集成板）を採用し、大林グループであるサイプレス・スナダヤ（愛媛県西条市）の日本最大級のCLT生産設備で製造しています。